천종식의 마이크로바이옴 강의
서울대 천종식 교수 (천랩 대표이사)의 마이크로바이옴 강의 시리즈입니다. Introduction to Microbiome – [Video] [pdf] Bacterial Species Concept, 16S rRNA gene & Average Nucleotide Identity (ANI) – [Video] [pdf]
서울대 천종식 교수 (천랩 대표이사)의 마이크로바이옴 강의 시리즈입니다. Introduction to Microbiome – [Video] [pdf] Bacterial Species Concept, 16S rRNA gene & Average Nucleotide Identity (ANI) – [Video] [pdf]
면역항암치료(anti-PD-L1)를 돕는 유의미한 미생물(biomarker) 찾기 장내 미생물 군집(gut microbiota)은 전신성 면역 반응을 형성하는데 중요한 역할을 합니다. 시카고 대학의 한 연구팀은 16S 기반 메타지놈 분석을 통해
16S 마이크로바이옴 시료를 시퀀싱하는 과정에 문제가 없는 지 검증(validation)하기 위해 사용되는 Microbiome Standards 제품에는 여러 종류가 있습니다. 보통 조성이 정확하게 밝혀져 있는 여러 미생물 종
CLgenomics는 미생물 유전체 분석을 위한 독립실행형 데스크탑 소프트웨어입니다. 이 프로그램은 동시에 여러 개의 유전체에 대한 정보를 시각화하여 보여주는 브라우저를 내장하고 있어 빠르고 즉각적으로 미생물 유전체를
근사유전체 (Pseudogenome)는 염기서열이 분석된 특정 유전체의 조립된 모든 컨티그 (contig)를 인공적으로 연결한 가상의 유전체입니다. 유전체를 시퀀싱 한 후 계산되어져 생성되므로 자연적으로 존재하는 실제 분자는 아닙니다.
원핵생물에 있어서 intergenic region은 spacer라고도 불리며, 유전자 사이의 연장된 부분을 가리킵니다. 통계분석에서는 보통 인접한 두 CDS (protein-coding genes/open reading frames) 사이의 공간으로 간주되며 intergenic region이
이 Tutorial은 건강한 사람과 환자의 호흡기 샘플을 비교하여 분석하는 과정을 소개하는 설명서입니다. 내용을 따라가면 EzBioCloud의 microbiome taxonomic profiling(MTP) 사용법을 손쉽게 배울 수 있습니다. Tutorial에 사용된
이 Tutorial은 EzBioCloud(http://www.ezbiocloud.net/)의 비교 유전체(comparative genomics) 분석 이용 방법을 설명하기 위해 작성되었습니다. 여러분의 이해를 돕기 위하여 잘 알려진 병원성 미생물인 Vibrio cholerae (콜레라 원인균) 를
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